Les variants KP.3 et KP.2 de la COVID-19 provoquent une recrudescence estivale

De nos jours, les étés s’accompagnent non seulement de vagues de chaleur étouffantes, mais aussi de poussées saisonnières d’infections à la COVID-19.
Les dernières données des Centres pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) suggèrent que la vague estivale de COVID-19 est désormais à nos portes. Le nouveau variant hautement transmissible à l'origine d'un nombre important d'infections est le LB.1, qui est responsable d'environ 1 nouveau cas sur 10.
« Au 2 juillet 2024, nous estimons que les infections à la COVID-19 augmentent ou sont susceptibles d'augmenter dans 39 États et territoires », rapporte le CDC, ajoutant qu'aucun État ne connaît actuellement de déclin ou de déclin probable, tandis que dans 10 États, les infections sont stables ou incertaines.

Au cours de la semaine se terminant le 6 juillet, les tests positifs de COVID-19 ont augmenté de 0,8 %, les visites aux urgences liées à la COVID ont bondi de plus de 23 % et les hospitalisations ont augmenté d'un peu plus de 13 %.

« Nous observons une hausse attendue de l’épidémie en été », explique le Dr William Schaffner, spécialiste des maladies infectieuses et professeur de médecine préventive et de politique de santé à la Vanderbilt University School of Medicine de Nashville, dans le Tennessee. « La COVID ne disparaît pas pendant l’été comme le fait la grippe. Si nous examinons les deux dernières années, nous avons constaté une augmentation pendant les mois d’été. Elle diminue à nouveau à l’automne, puis on observe une véritable augmentation saisonnière pendant l’hiver. »

Après un week-end chargé du 4 juillet, au cours duquel des millions d'Américains ont voyagé et où des familles et des amis se sont réunis à travers le pays, on peut s'attendre à ce que les chiffres du COVID-19 augmentent encore plus.

« Les chiffres de la COVID-19 sont en hausse en raison d’une constellation de facteurs, notamment le nombre croissant de personnes se rassemblant à proximité les unes des autres, le nombre croissant de personnes voyageant et le nombre croissant de personnes se réfugiant à l’intérieur pour échapper à la chaleur extrême », explique le Dr Peter Chin-Hong, spécialiste des maladies infectieuses et professeur de médecine à la faculté de médecine de l’université de Californie à San Francisco.

Une nouvelle série de variants et la diminution de l’immunité vaccinale pourraient également contribuer au problème, ajoute le Dr Chin-Hong.

Les nouveaux Ks sur le bloc et la montée de LB.1

Depuis que la COVID-19 a commencé à se propager dans le monde il y a plus de quatre ans, le virus a rapidement muté. De nombreuses versions du virus ont pu échapper aux défenses immunitaires développées par les personnes infectées ou vaccinées, même si les versions plus récentes de la COVID-19 n'ont pas provoqué de maladie aussi grave que celles apparues au début de la pandémie.

Les dernières souches responsables de plus de la moitié des cas actuels sont KP.3 (24,5 % des infections), KP.2 (21,5 %) et KP.1.1 (8,9 %). Elles appartiennent toutes à une famille de variants très contagieux appelés FLiRT, abréviation des noms techniques de leurs mutations spécifiques.

Le variant LB.1, hautement transmissible, est étroitement lié aux souches FLiRT, mais présente une mutation supplémentaire. Ces quatre principaux variants sont tous des descendants du variant omicron JN.1, qui représente désormais un peu plus de 7 % des cas, mais représentait plus de la moitié des infections fin mars.

Faut-il se faire vacciner maintenant ou attendre ?

Alors que le virus évolue rapidement, les fabricants de vaccins tentent de suivre le rythme et d’ajuster leurs formules pour être plus efficaces contre les souches en circulation.

La Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis a recommandé en juin que les nouveaux vaccins soient composés de manière à s'attaquer aux souches de la lignée JN.1 et, si possible, à cibler spécifiquement la souche KP.2.

Le Dr Schaffner note qu’à ce stade, il est très peu probable que le vaccin d’automne puisse être ajusté davantage pour lutter directement contre une nouvelle variante émergente comme le LB.1. « Il y a un délai limité pour fabriquer ces vaccins, les mettre en flacon et les distribuer », dit-il. « Les souches dominantes actuelles sont cependant toutes des sous-variantes de la famille des omicron, donc on s’attend à ce que ces vaccins contre les souches KP fournissent des anticorps qui protégeront contre le LB.1. »

Fin juin, le CDC a recommandé que toute personne âgée de 6 mois et plus reçoive un vaccin COVID-19 2024-2025 mis à jour dès qu'il sera disponible cet automne.

Alors qu’une mini-vague de COVID-19 se produit actuellement, les gens peuvent se demander s’ils doivent attendre les nouveaux vaccins ou prendre immédiatement d’autres mesures de protection.

Pour Chin-Hong, la réponse est assez simple : « Le vaccin a-t-il été approuvé à l’automne 2023 ? Sinon, je me le ferais, surtout si vous avez plus de 65 ans et que vous êtes immunodéprimé », dit-il. « Les personnes de 65 ans et plus peuvent également recevoir un autre vaccin si quatre mois se sont écoulés depuis le dernier. Cela leur permettra toujours de recevoir le nouveau vaccin avec le vaccin contre la grippe en octobre ou novembre. »

À quel point devrions-nous nous inquiéter ?

Alors que les visites aux urgences sont en hausse aux États-Unis, seul Hawaï en est à un stade considéré comme « substantiel » ; et les taux de tests positifs à l’échelle nationale n’ont pas encore atteint un niveau menaçant.
Les analyses des eaux usées (eaux d’égout), qui peuvent aider les scientifiques à prédire si la COVID-19 augmente ou diminue, montrent des signes encourageants indiquant que la poussée estivale pourrait bientôt se stabiliser. À l’échelle nationale, le niveau d’activité virale des eaux usées pour la COVID-19 est actuellement faible.
Même si les chiffres de la COVID-19 sont globalement en hausse, la plupart des infections ont été relativement bénignes et la vaccination a contribué dans une large mesure à la guérison. Comme l’indiquent les CDC, les vaccins contre la COVID-19 sont efficaces pour protéger les personnes contre les maladies graves, les hospitalisations et la mort. Schaffner souligne que le vaccin contre la COVID-19 transforme l’infection de « sauvage » en « bénigne ».

Des traitements tels que le nirmarelvir et le ritonavir (Paxlovid) et le remdesivir (Veklury) ont également prouvé leur efficacité pour empêcher une infection de devenir grave.

« Heureusement, les hôpitaux n’ont pas été débordés comme les années précédentes, ce qui témoigne de l’immunité collective de la population », explique Chin-Hong. « Néanmoins, certaines personnes risquent de tomber gravement malades : principalement les personnes âgées de plus de 75 ans ou celles qui sont très immunodéprimées et qui n’ont pas reçu le dernier vaccin ou à qui on a prescrit du Paxlovid ou du remdesivir lorsqu’elles ont été infectées. »

Soyez attentif aux symptômes de la COVID-19

Le CDC continue de mettre en garde contre les symptômes courants du COVID-19 tels que la congestion ou l'écoulement nasal, les maux de gorge, la fatigue et les maux de tête.

Chin-Hong dit qu'il constate moins de symptômes qui étaient courants en 2020, comme l'essoufflement et la perte du goût et de l'odorat, et que certaines personnes souffrent de nausées et de diarrhée – des symptômes dont elles ne réalisent peut-être pas qu'ils peuvent être liés à la COVID-19.

Les symptômes de la COVID-19 étant souvent similaires à ceux des allergies (comme le rhume des foins) ou du rhume, les médecins préviennent que la seule façon de le savoir avec certitude est de faire un test COVID, surtout si vous êtes vulnérable à une infection grave (si vous êtes âgé, par exemple, ou si vous êtes immunodéprimé) et que vous souhaitez éviter une maladie grave en suivant un traitement au Paxlovid. Vous devez également faire un test si vous passez du temps avec une personne à haut risque que vous pourriez infecter.

De manière anecdotique, certaines personnes sur les réseaux sociaux signalent quelques effets assez désagréables du virus actuellement en circulation. Un commentateur de CNBC a récemment écrit sur X :

« J'ai été testé positif au COVID il y a quelques jours. Les trois premiers jours de symptômes étaient pires que ceux d'il y a deux ans. Parmi eux, un mal de gorge profond et persistant. Dieu merci pour le Paxlovid. Il semble fonctionner. Portez votre masque. La nouvelle variante semble faire une petite poussée cet été. »